Miglioramento genetico avanzato

Il programma viene sviluppato in due moduli. Nel primo vengono fornite le basi di genetica quantitativa e di selezione attraverso l'approccio genomico che ha rivoluzionato il processo selettivo e sta cambiando l'approccio gestionale degli animali in produzione zootecnica. Nel secondo modulo viene sviluppata la parte relativa alla stima del valore genetico / genomico degli animali con riferimenti specifici alla selezione genomica nelle popolazioni.

'H53-49-A' - 'Unita' didattica: Genetica quantitativa e selezione'.
OBIETTIVI DEL MODULO:
Il modulo ha come obiettivo fornire le conoscenze per l'interpretazione della relazione tra fenotipo e genotipo, centrale nella genetica quantitativa e nella selezione dei riproduttori. Le informazioni genomiche oggi disponibili sono una componente di base per la genetica quantitativa moderna.

ARTICOLAZIONE DEL MODULO:
Didattica frontale
1) Sequenziamento e genotipizzazione;
2) I chip di genotipizzazione per marcatori SNP;
3) Marcatori genetici e loro utilizzo nella gestione genomica delle popolazioni;
4) La variabilità genomica e fenotipica nelle specie in produzione zootecnica;
5) Strutture genetiche delle popolazioni: F1, F2, Backcross, popolazioni in Outbreeding, ibridi commerciali;
6) Quantitative Trait Loci e marcatori - linkage;
7) Parentela genomica e inbreeding genomico;
8) Il modello genetico infinitesimale in chiave genomica;
9) Concetto di Breeding Value e sua stima a partire da una o più fonti di informazione;
10) Accuratezza del valore riproduttivo e SEP. Base genetica;
11) Correlazione tra caratteri e risposta correlata;
12) Indici economici composti;
13) Gli schemi di selezione dei riproduttori;
14) Risposta alla selezione;
15) Gestione della variabilità genomica;

Esercitazioni
Le esercitazioni saranno sviluppate in aula computer su software specifici per la selezione dei riproduttori e per la gestione dei dati genomici. Gli studenti dovranno utilizzare l'ambiente R "The R software for statistical computing" (https://www.r-project.org/) (https://www.rstudio.com/).

'H53-49-B' - 'Unita' didattica: Modello misto e selezione genomica'

OBIETTIVI DEL MODULO:
Il modulo ha come obiettivo fornire le basi della valutazione genomica nelle specie in produzione zootecnica e la sua applicazione nei programmi di selezione.

ARTICOLAZIONE DEL MODULO:
Didattica frontale
1. Il contributo delle informazioni al valore riproduttivo
2) Il modello di valutazione genetica
3) Sistemi di equazione in algebra delle matrici (OLS/GLS)
3) Il modello misto e la stima dell'EVB con relazione al modello genetico
4) Varianza genetica e varianza ambientale;
5) Il sire model
6) Selezione Genomica: strumenti, popolazioni, equazioni di predizione;
7) La stima del valore di sostituzione genica nel modello a un locus;
8) La stima delle equazioni di predizione dalla "training population";
9) Applicazione delle equazioni di predizione nella "application population"
10) Il Valore Riproduttivo Genomico (GEBV);

Esercitazioni
Le esercitazioni saranno sviluppate in aula su Microsoft Excel e software specifici per la selezione dei riproduttori e per la gestione dei dati genomici. Gli studenti dovranno utilizzare l'ambiente R "The R software for statistical computing" (https://www.r-project.org/) (https://www.rstudio.com/).